Année 2029, le monde est entré dans une ère d'information à outrance. Mais les pays et les groupes ethniques subsistent, dont un étrange état-consortium appelé "Japon". Dans ce monde totalement cybernétisé, la major Motoko Kusanagi est un soldat d'élite à la tête d'une unité d'assaut "de libération d'otages", qui se charge également des sales besognes dans un univers de complot et de manipulation.