Balto est maintenant le père d'Aleu. Celle-ci découvre qu'elle ne sera jamais acceptée de la même façon que ses frères et soeurs, car elle ressemble davantage à un loup qu'à un chien. Bouleversée, elle s'enfuit. Inquiet, Balto part à sa recherche. Une aventure héroïque, mettant en scène des loups dans les étendues glacées de l'Alaska.