Jim, un jeune garçon, récupère par hasard une carte menant au fameux trésor du capitaine Flint. Sur une embarcation de fortune, il décide de partir à la recherche du trésor, accompagné de son amie la souris. Mais en chemin, ils sont capturés par de dangereux pirates et vendus comme esclaves. En prison, Jim fait la connaissance de Cathy, la petite-fille du capitaine Flint. Commence alors un voyage périlleux pour tenter d'atteindre le fabuleux trésor avant les pirates...