Quelques années après les événements de «La mémoire dans la peau», David Webb est devenu professeur d'études asiatiques à Georgetown, Kentucky. Mais, un jour, il devient la cible d'un assassin aussi habile que lui et la CIA lui met sur le dos le meurtre de deux de ses collègues. Webb, pour sauver sa peau, doit à nouveau endosser l'identité de Jason Bourne et retrouver sa détermination de tueur.